合併初期，港鐵仍有使用千九列車標誌，只將九鐵標誌刪除；而路綫顔色也因避免與前地鐵港島綫重複，由深藍色更改為淺藍色。 金鐘站東鐵線 上水屠房1999年8月啟用後，牲畜列車不再沿東鐵綫前往何文田牲口站，取而代之是經羅湖站直去不遠的上水屠房，對沿線乘客與居民的滋擾從此消失。 金鐘站東鐵線 來往大埔墟車站至羅湖車站的電氣化鐵路於1983年7月15日啟用，亦象徵九廣鐵路（英段）全線電氣化工程正式完成。
建於擴建部分之升降機門外，港鐵以全幅紅色牆身及特大字型提醒搭客讓有需要人士優先使用，在近年優先座「批鬥」文化盛行下，被部分網民及傳媒譏為「關愛𨋢」[4]。 縱使如此，港鐵已陸續於其他車站的升降機增設大型紅色「優先使用」標貼。 目前金鐘站只有一部連接車站擴建大堂東部和地面及夏慤花園平台的站外升降機；港鐵解釋，礙於地理環境所限，金鐘站只可裝設一部站外升降機。
金鐘站東鐵線: 路軌折曲事故
L2及L3層月台均可供搭客跨月台轉乘，往返港島綫（灣仔至柴灣）及荃灣綫（尖沙咀至荃灣）的乘客只須走過對面月台，便可轉乘另一綫列車。 兩綫路軌並非平行，荃灣綫路軌位於夏慤道及海富中心下（北面），港島綫路軌則位於德立街下（南面）。 金鐘站東鐵線 金鐘站東鐵線 四個月台都向外彎曲（車卡中央部分空隙最闊），令月台不同位置寬度不一，在港鐵沿綫各站島式月台之中較罕見。 由於月台彎曲引致月台與列車之間空隙較闊，列車到站時會播出「請小心月台空隙」的廣播，月台地面邊緣更貼上曾為此站獨有之大型「請小心月台空隙」標貼。
港鐵東鐵線過海段5月15日通車，運輸及房屋局局長陳帆在網誌感謝工程團隊在施工期間成功克服各種困難，令項目順利完成。 金鐘站東鐵線2023 他表示，日後東鐵線貫通南北，乘客無須轉線便可從新界東北直達港島，既方便快捷，也有助減輕路面交通擠塞的情況。 然而在2021年4月3日，港鐵透過其facebook專頁公開金鐘站擴建部分的照片，有網民批評設計脆弱，擔心雨天時車站會出現漏水情況，又認為沙中線為千億「豆腐渣工程」[51]。 至於車站大廳亦為配合新擴建部分之用色而進行全面翻新工程，包括將大廳之藍色紙皮石及焗漆板，更換成白色仿麻石牆，以及在C出口旁的一端牆壁換成「藍色黃色漸變間條玻璃板」，是全港鐵市區線網路中首次使用，亦是繼東涌站及博覽館站後再次使用玻璃板。
金鐘站東鐵線: 南港島綫發展
E1及E2出口現已拆卸回填作車站擴建工地之用，原址新建之E出口將於南港島綫通車時局部啟用，並續作沙田至中環綫工地，該綫通車後全面啟用[8]。 金鐘站大堂位於L1層，已入閘區設於中央，四面為MTR Shops及出口通道包圍；出入閘機分別設於閘區南北兩邊，以便乘客進出，屬罕有港鐵車站設計。 車站大堂設多組扶手電梯及樓梯，當中大部分扶手電梯直接連貫月台及大堂，只有一條來往兩層月台之間，屬典型修正早期系統轉綫站。 來往全部三層之升降機於2008年3月8日啟用，位於大堂西面，有專用已入閘區，與中央閘區分開。 根據2021年立法會財委會文件，東鐵綫於2018年至2020年共發生111宗乘客進入路軌事故。 而早在2013年，當時港鐵稱準備為東鐵綫安裝幕門，並需更改月台結構、更新列車及更新信號系統。
- 至於週末於沙田馬場舉行賽事期間，入場時段會安排羅湖開出之南行列車途經馬場，北行列車則於金鐘開出並以上水為終點站。
- 主大堂、L2及L3層以一部升降機連接，大堂西面有一對闊閘機，專供升降機乘客使用，且不能於大堂層通往中央閘區。
- 2003年11月，地鐵大幅修改南港島綫走綫規劃，為此提出三個初步方案，其中兩個方案建議金鐘作北端總站；另一以灣仔為總站，但亦可延伸至金鐘。
- 來往沙田車站至大埔墟車站的第二期電氣化工程於1983年4月26日完成，大埔滘車站在當日起永久停用。
新列車由Hyundai 金鐘站東鐵線2023 Rotem Company在南韓設計、製造以及營運測試。 每列列車有9卡車廂，配備多項比舊有列車更完善的設施，包括二極管（LED）車廂照明及動態路綫圖系統，而乘客資訊系統亦會採用27吋液晶體顯示屏（LCD）。 經過全面改善設施的馬場車站於1985年10月1日啟用，趕及沙田馬場新公眾看台落成前重開。 由於原有白石角段彎多容易出軌，該段於1995年拉直並改為與吐露港公路平排，以節省行車時間及減少意外發生。 1955年9月2日，九廣鐵路局邀請港督葛量洪爵士及其夫人慕蓮女士在尖沙咀火車站替首兩輛柴油機車進行啟用儀式。
金鐘站東鐵線: 列車編組
以上水至金鐘為例，乘客現時轉車兩次，日後不需轉車，車程省卻15分鐘；由紅磡到金鐘則只需七分鐘，車程省卻12分鐘。 運輸及房屋局局長陳帆昨日在記者會上表示，運輸署會加強會展站接駁鄰近地區的公共交通服務，監察沿線的公共交通服務情況，以及與巴士公司等其他公共交通營辦商就市民出行的習慣及需求，作出適當的調整。 因此，所有來往尖東站的頭等額外費將不再適用, 而東鐵綫所有其他車站的頭等額外費將維持不變。 乘客透過使用「行程指南」，直接點選起點和目的地車站後，即時顯示多項港鐵重要旅程資訊，包括車費、建議路綫、預計乘車時間、轉綫站、轉綫指示及月台編號、起點站服務時間、頭班車及尾班車資料等便會即時顯示。 東鐵綫市區總站為金鐘，邊境總站為羅湖及落馬洲，而馬場站只於沙田馬場賽馬日和跑馬地馬場賽馬日進行雙邊投注才開放使用。 港鐵在2012年12月14日批出沙中綫37列新列車及訊號系統採購合約。
雖然大部分東鐵綫全綫車站洗手間已經在2015年至2016年翻新，廁所都只提供座廁，但是東鐵綫少部分廁所設計非常狹窄和使用率甚高，引致部分廁所衛生問題日益嚴重，結果有時廁所臭氣沖天情況間中出現惡化。 然而有有線新聞的記者進行實測後，發現往返上述兩站需時約21分鐘[125]。 往落馬洲站的班次佔全綫的三分之一，但較少人乘搭；往羅湖站的班次被分薄，導致每班列車更多人。 在2012年，東鐵綫每日平均乘客量為逾102.2萬人次，當中有約24萬人次往返羅湖站；另有約六萬人次往返落馬洲站，而繁忙時間平均載客率達71%。
金鐘站東鐵線: 紅磡站告別舊月台 新東鐵月台上一層轉屯馬線
不過直到2021年2月6日，港鐵宣布採用9節編組的新列車投入服務後，有乘客表示原本在平日早上非繁忙時間不須等車，現在卻要等一至兩班，擔心疫情過後情況會更差[74]。 在屯馬綫一期（大圍至啟德段）通車前，本綫是唯一能直接轉乘馬鞍山綫的港鐵路綫，有不少馬鞍山綫乘客會在大圍站轉乘東鐵綫前往市區。 在部分車站，尤其是作為觀塘綫轉乘站的九龍塘站及與馬鞍山綫連接的大圍站，經常出現極度擠迫的情況。
因為九廣鐵路有相當長的時間使用這些機車行走，故對印象深刻的香港市民口中仍習慣將其稱為「火車」，其車站亦稱為「火車站」，情況在老一輩香港人中尤為普遍。 而部分以東鐵綫車站為終點站的香港巴士路線的目的地名稱曾使用「火車站」一詞，如「沙田火車站」、「旺角火車站」等，並且至今仍然有部分小巴路線使用「火車站」一詞作為目的地名稱。 新列車車廂比現有列車車廂稍闊，配置經改良設計的扶手及二極管（LED）車廂照明系統，為乘客提供更寬敞舒適的乘車環境。
金鐘站東鐵線: 月台
旺角東站、沙田站、粉嶺站和上水站的橫式站牌在翻新工程後全部拆除。 現時每輛東鐵綫列車均有一卡為頭等車廂（往羅湖／落馬洲方向設於第4卡；往金鐘方向設於第6卡），車廂內設置軟座，而座椅間距較為寬闊，環境也較為舒適。 乘客如欲乘坐頭等車廂，必須在入閘前購買頭等單程票、透過MTR Mobile或AlipayHK選定頭等二維碼車票，或在月台上之頭等核准機拍八達通卡以取得頭等核准。 頭等車費即普通等車費加頭等額外費，而頭等額外費相等於該車程之成人單程車費。 然而，於新信號系統投入服務前一晚，港鐵臨時宣佈新系統延遲投入服務[19][20]。
- 直至1989年觀塘綫延伸至鰂魚涌站後，荃灣綫並不再是往返港島區及九龍區之間的唯一一條地鐵路線，而經觀塘綫往返港島區及九龍區的乘客也無須支付繁忙時間附加費，轉乘人流才稍為回落。
- 當時駕駛該列車的車長張振斌決定將列車駛往金鐘站，並以廣播通知乘客準備疏散。
- 港鐵車務營運總管李聖基事後向傳媒表示，有關行為「很危險」[95]。
- 部分月台又由於設計問題造成月台邊緣與車廂之間的空隙特別闊，而在2011年與2016年亦分別有一名20多歲少女、一名3歲男童和一名老婦不慎從車廂與月台間空隙墮下路軌[129][126]。
- 而L5層轉車通道和L6層月台建於太古廣場下方岩石地層開挖的大型岩洞內，其建造方式與太古站類同，[3]乘客從轉車通道可清楚到觀察到其拱頂設計。
- 港鐵香港客運服務總監楊美珍舉例指出，現時從沙田往銅鑼灣需轉乘3次車、車程需時36分鐘，過海段通車後只需在金鐘站轉一次車、車程減至約27分鐘（見表）。
- 舊彎位（樟樹灘走線）現在是香港教育大學運動場及香港中文大學賽馬會研究生宿舍二及三座連未撥用土地。
項目中曾稱為南北走廊（North South Corridor）或南北綫（North South Line），但最終未有使用此名，並且於東鐵綫過海延伸後仍繼續維持原稱。 東鐵綫過海段原本可望於2021年12月底通車，但沙中綫工程因爆出偷工減料醜聞，通車日期而被延遲。 1930年，中國第一次國共內戰爆發，城際直通車服務再度中斷運作。
金鐘站東鐵線: 月台頭尾站牌
而東鐵綫部分車站月台與列車之間的空隙較闊或高度相差較大，故須通過加裝月台伸縮踏板以解決問題。 港鐵曾於2008年在羅湖站試驗加裝月台伸縮踏板，但試驗效果不理想並在月台加固工程時拆除，現已改為與加建月台閘門工程一并進行。 港鐵初時預計2020年全面完成[41][42][43][44][45][46][47][48][49]，而馬場站及大埔墟站已率先進行月台加固及月台閘門安裝工程[50]，為東鐵綫加裝月台閘門揭開序幕。 早期行走九廣鐵路的列車由蒸汽機車牽引，直至1962年柴油機車全面取代蒸汽機車行走於九廣鐵路英段的線路上。
而配合整體鐵路規劃，工程項目亦改稱為「南港島綫（東段）」，於2011年7月8日正式動工[17]。 工程期間，設於樂禮街之E1及E2出口在2011年7月10日起封閉，拆卸作車站擴建工地[18]。 1980年2月12日，地下鐵路修正早期系統中環至尖沙咀段通車，金鐘站隨即開放，與中環站成為當時地下鐵路唯獨兩個設在香港島的車站。 由於在建設金鐘站時已經預計該站成為港島綫的轉車站，所以初期的金鐘站已經設立上下層兩個側式月台。
金鐘站東鐵線: 使用狀況
2021年10月6日，時任行政長官林鄭月娥在《施政報告》中提及東鐵綫擬伸延至深圳羅湖口岸，並於現有的羅湖站和上水站之間增設羅湖南站，连接北环线东延段，主要用於服務在羅湖及文錦渡的商住用途[148]。 2018年，香港大學最新研究發現，東鐵綫扶手細菌抗藥性基因最高，透過深圳過境乘客不斷轉乘而散播社區抗藥菌至全港。 馬鞍山綫（現為屯馬綫）檢測出的耐藥性細菌含量亦幾乎與東鐵綫相同。
至於週末於沙田馬場舉行賽事期間，入場時段會安排羅湖開出之南行列車途經馬場，北行列車則於金鐘開出並以上水為終點站。 散場期間，最後一班北行列車以上水為尾站，亦會開出一班於馬場站起載的南行列車前往金鐘。 東鐵綫過海段經過多次通車日期的延誤，港鐵公司於2021年10月22日宣佈過海段預計於2022年6至7月通車[27][28][29]。 而全綫試車亦在2月1日展開，由當天起，部份列車會在非繁忙時間來回行走落馬洲至金鐘[30][31]。 港鐵公司再於2022年5月3日宣佈過海段將於2022年5月15日通車[32] [33]，較預計通車日期早，正式開啓百年鐵路新一頁。
金鐘站東鐵線: 轉乘優惠
東鐵綫沿綫大部分均為地面路段，而且是大部份車站未有設置月台幕門／閘門的路綫（除了紅磡站、會展站、金鐘站已經安裝月台幕門之外），因此不時出現跳軌自殺事件，或有乘客非法橫過路軌前往對面月台，導致列車服務受阻。 港鐵公司配合鐵路警區、邊界警區之行動對長期逗留月台之水貨客採取屢勸不聽後處之以罰款港幣2,000元。 金鐘站東鐵線2023 同時港鐵在車站加派職員在入閘機前監視[119]，並聘請了廉政、申訴專員公署和紀律部隊退休員工成立逃票罪行防治組[120][121]，而加強執法以來港鐵錄得了更頻密的職員執勤時遇襲數字[122]。
自2002年將軍澳線啟用後，觀塘線乘客須在油塘站轉乘將軍澳線往返港島區及九龍區，而將軍澳線於離峰時間班次較觀塘線疏落，車程較之前多花費最少4分鐘[27]，這不便讓不少觀塘線沿線各站的乘客改回經旺角站及金鐘站往返港島區及九龍區，金鐘站人流亦因而回升。 位於車站荃灣線／港島線月台以西則設有3條可停泊列車的金鐘側線[16]，並延伸至中環站荃灣線月台下方，可供列車調頭、調度或讓列車往返港島線與荃灣線之間。 另外港鐵亦為方便乘搭荃灣綫或東鐵綫前往九龍區或新界區的乘客，故在車站大堂及月台加設數部名為「過海易」的顯示屏，而屏幕上會顯示月台實時模擬影像以及列車班次資料[50]。 位於車站荃灣綫／港島綫月台以西則設有3條可停泊列車的金鐘側綫[16]，並延伸至中環站荃灣綫月台下方，可供列車調頭、調度或讓列車往返港島綫與荃灣綫之間。 金鐘站東鐵線2023 另外，東鐵線將於本月7日起以9卡列車行駛，港鐵本月6日為現役12卡列車舉行榮休活動。
金鐘站東鐵線: 車站擴建及改善工程
中環南站的前身為中環西站，2001年政府邀請兩鐵競投沙中綫時，當局構思中的中環西站位於荷里活道近擺花街，鄰近中區警署（現稱大館）﹐方便市民直接到蘭桂坊一帶消遣和上班[151]。 2002年九鐵奪得沙中綫營運權後，決定將中環西站東移，更為接近蘇豪區及中環心臟地帶[152]。 直至2004年，九鐵將沙中綫改為「不直接過海」，同時稱中環西站選址土質鬆軟，難以施工，決定改為研究在上亞厘畢道以南建站[153]。
在1998年東涌綫啟用後，往返港島區及九龍區的地鐵路綫增至3條。 乘客可通過香港站經轉乘通道前往中環站轉乘港島綫，在平日繁忙時間起到分流作用，然而由於東涌綫在非繁忙時間的班次疏落，故分流效用不太高。 根據1994年發表的《鐵路發展策略》，南港島綫於金鐘所設的車站位於太古廣場（現金鐘站以南），並被命名為「太古廣場站」。 直至2002年地鐵公司重新研究南港島綫，一度將終點站改為灣仔站而不前往金鐘站，惟最終為方便乘客轉車而將終點站設於金鐘站。 1985年5月31日，當金鐘站成為地鐵荃灣綫及港島綫的轉車站之後，車站的月台地板是採用兩種不同的顏色原料設計。
金鐘站東鐵線: 羅湖南站
例如在沙田站，晚上大批乘客爭先恐後登上接駁巴士，有人甚至爬窗進入。 由於出事地點及其附近路段（尤其是急彎部分）多年來屢次出現不同程度的意外，鐵路公司其後趁政府落實白石角填海工程時，於1995年9月24日凌晨，利用收車時間將路段拉直至與吐露港公路平衡，而行車時間得以縮減一分鐘；而有關工程就耗資6,500萬元[26]。 金鐘站東鐵線2023 舊彎位（樟樹灘走線）現在是香港教育大學運動場及香港中文大學賽馬會研究生宿舍二及三座連未撥用土地。
