1896年（明治29年）7月，於嘉義市三角窗街（今光彩街與文昌街交叉點東南一帶）新建院舍，設有病房。
臺灣醫療院所經由財團法人醫院評鑑暨醫療品質策進會分類為「一般醫院」及「精神科醫院」兩大類。 各有兩項評鑑依據，分別為「醫院評鑑」及「教學醫院評鑑」兩項。 署立嘉義醫院2023 其中醫院評鑑項目，在一般醫院有「特優」、「優等」、「合格」三個等級，而精神科醫院則有「優等」、「合格」二個等級。 教學醫院評鑑等級無論一般醫院及精神科醫院，其等級皆有「優等」、「合格」、「非教學醫院」三個等級。 署立嘉義醫院2023 署立嘉義醫院2023 署立嘉義醫院 1999年（民國88年）7月，臺灣省虛級化，改隸行政院衛生署，更名「行政院衛生署嘉義醫院」，簡稱署嘉醫院。
