2002年，長榮航空進行企業內部改革，裁減員工數員並簡化管理，因為亞洲金融風暴對於營收造成重大影響，2002年和2003年的SARS也影響到來往東南亞及北美的航班，來往歐洲的航班受到的影響較小，但依然有一些影響。 自1995年4月開始貨運業務，首架麥道MD-11貨機飛往台北、新加坡、檳城、舊金山、紐約和洛杉磯；同一年年底貨機機隊擴大到5架，在此之前，長榮航空貨物運輸主要依靠客機的貨艙運送。 長榮航空自創立至今未曾發生致死之航空事故，擁有卓越的飛航安全記錄。 2016年至2019連續四年獲得Skytrax評為五星級航空公司並持續至今，為全球第八家獲此榮譽的航空公司[4]。 長榮航空logo2023 免稅商品購物目錄《EVA Sky Shop線上購物誌》，免稅商品大多都在供餐之後開始進行販售，旅客也可以事先在網絡上預購，搭乘航班時領取即可。
此外，國際航班也提供免費的報紙和雜誌刊物，根據不同的路線而有不一樣的選擇。 免稅商品購物目錄《EVA Sky Shop線上購物誌》，免稅商品大多都在供餐之後開始進行販售，旅客也可以事先在網路上預購，搭乘航班時領取即可。 1991年7月，長榮航空開航，初期的機艙配置有商務艙和經濟艙[5]。 最初從臺北出發的目的地包含曼谷、雅加達、新加坡和吉隆坡，同年底長榮航空網絡已擴大到其他東亞城市和歐洲的維也納。
長榮航空logo: 彩繪機
長榮航空的航線網路受到台灣的政治地位影響，飛航歐洲和一些亞洲國家的限制較大[30]。 長榮航空logo 第一代：1991年3月~2003年3月，空服員(CA)皆穿著鑲著淺綠色線條的白色襯衫，搭配雅綠色合身及膝套裝，襯衫領口別上橘色綠邊(或綠色橘邊)領結，外套鈕扣則搭配象徵長榮集團的地球羅盤金色鈕扣。 1988年9月，在長榮海運慶祝成立20周年之際，董事長張榮發宣布建立臺灣第一間私人的國際航空公司。 1998年7月1日，收購大華航空和台灣航空，並與長榮現有的國內業務合併，立榮航空成為長榮航空旗下專責經營臺灣國內航線的子公司，經營國內短程航班。 2007年到2008年間，由於燃油價格狂飆34%，長榮航空在2007年就損失了6,120萬美元[11]。 2008年8月，長榮航空公佈第二季度虧損超過500億，因為燃料成本暴增[13]。
「皇璽桂冠艙」（Royal Laurel Class）是新一代的商務艙。 長榮航空logo 配置於波音 長榮航空logo ER、波音787-9及波音787-10三種機型。
長榮航空logo: 長榮航空
同時為考量商務人士需求，每個商務艙座位亦提供110V電源插座。 2015年11月24日與波音公司、奇異(GE)航空集團共同舉行新機簽約儀式。 由長榮航空董事長張國煒、波音商用飛機集團總裁暨首席執行官雷•康納(Ray Conner)及奇異航空集團副總裁兼全球銷售及市場總經理薛克•沙茹(Chaker Chahrour)共同簽署。 此次簽約後長榮航空將規劃引進26架飛機，包括18架波音787-10及2架波音 ER確認訂單以及6架波音787-9選擇權。
為了彌補損失，長榮航空實施成本節約措施，削減航班並調漲機票價格[14]。 長榮航空logo2023 2008年初位在加州的辦事處宣佈裁員，有一半以上的工作人員被告知該年5月起不再受聘[15]，加上將新招募空服員延後報到。 自1995年4月開始貨運業務，首架麥道MD-11貨機飛往台北、新加坡、檳城、三藩市、紐約和洛杉磯；同一年年底貨機機隊擴大到5架，在此之前，長榮航空貨物運輸主要依靠客機的貨艙運送。 長榮航空徽號以綠色為底色，象徵沉穩與永續，而橘色則代表科技革新。
長榮航空logo: 服務
其主要業務為經營國際客運及貨運航線[3]，成立之初亦提供國內航線服務，但在1998年後全面轉由同集團內的立榮航空負責。 1992年開始提供豪華經濟艙服務，是全球第一家設立此種客機艙等的航空公司。 2013年6月18日起加入星空聯盟，成為臺灣第二家加盟航空聯盟的航空公司。 長榮航空（英語：EVA Air，以字母E-V-A讀音）是一家臺灣航空公司，為長榮集團旗下主要公司之一，1991年開航，以桃園國際機場為樞紐機場，總部則位於桃園市南崁。 長榮航空在全球主要目的地的機場設有機場貴賓室，包含：桃園機場（The Garden、The Infinity、The Star、The Club）、高雄小港機場及曼谷蘇凡納布機場，提供皇璽桂冠艙、桂冠艙、商務艙、豪華經濟艙以及持有無限萬哩遊鑽石卡、金卡、銀卡、星空聯盟金卡及特定信用卡的乘客使用[27]。 長榮航空的旗艦貴賓室位於台灣桃園國際機場第二航廈，備有獨立的休息室、花園和會所設施[27]，有獨立的餐飲設施，另有特別登機手續的設施提供給持有鑽石卡的乘客[27]。
- 星空聯盟成員班機，還有購物、租車、飯店住宿等，都可以累積里程。
- 2012年6月22日再推出名稱為「雲彩機」（編號B-16309）的第五架Hello Kitty彩繪機。
- 2018年10月2日，長榮航空首架租賃波音787-9「夢幻客機」，國籍編號B-17881，在位於美國南卡羅來納州查爾斯頓的波音工廠舉行交機典禮，長榮為凸顯國籍航空首次採用787機型，接受波音提供特殊外觀塗裝設計建議，在四架787-9機身上以放大的787字體，標示出787機型，在白色的機身上，以長榮集團綠、橘企業色綵帶的飛揚線條，呈現787夢幻客機的速度感[45]。
- 過往兩岸直航尚未開放之時，台灣的航空公司無法直接飛入中國大陸，必須利用香港和澳門兩機場做為中轉機場。
- 2015年6月再推出第七架Hello Kitty彩繪機，名稱為「星空機」（編號B-16722），用於6月19日首航台北－休士頓航線，由長榮航空董事長張國煒親自駕駛。
第二代：2003年4月~2017年11月29日，A-Line及膝連身立領洋裝，領口及胸線處別有代表長榮集團的地球羅盤鈕釦，外套則是U型領口合身剪裁的雅綠色外套。 空服員(CA、AP)及地勤的運務員著典雅綠色洋裝鑲滾白色線條，搭配淺雅綠色外套，外套袖口別有兩個地球羅盤鈕釦。 事務長(CP)及地勤的督導著連身洋裝則鑲橘色線條，外套則偏深雅綠色，事務長外套領線、袖口滾橘邊並在連身洋裝及外套袖口繡上兩條金色細線條，空服員教官(Instructor)則在連身洋裝及外套袖口上繡上一粗一細金色線條。 2004年，長榮航空確定其餘的8架波音 ER的訂單[9]，2005年7月，首架波音 ER投入服務，做為長榮航空的新旗艦飛機。
長榮航空logo: 個人工具
「桂冠艙」（Premium Laurel Class）是2003年推出的商務艙，配備於空中巴士A 客機及A 客機，座位配置單排2-2-2的組合，之後擴展至波音 ER型客機，取代原先的「超級頭等艙」。 新一代桂冠艙（部分A 客機）前後椅間距達62英吋，平躺時為78英吋，寬度達22英吋，此款座椅可以180度全平躺。 A 客機及部分A 客機配置桂冠艙，前後椅間距達62英吋，寬度達22英吋，加上符合人體工學的貼心設計，可以平躺臥床及獨立進出[22]，全艙等配置10.4英寸(A ) | 15.4～18英寸 長榮航空logo (A ) LCD螢幕，擁有110V AC電源插座、個人閱讀燈，以及可收式隔板，彷若置身家中般的便利；SMS & e-mail服務與個人專屬的衛星無線電話。 2011年10月31日推出第二代Hello Kitty彩繪機，首架名稱為「魔法機」（編號B-16331）。 2011年12月7日推出第二架彩繪機，名稱為「蘋果機」（編號B-16332）。 2011年12月23日推出第三架彩繪機，名稱為「環球機」（編號B-16333），以上三架均為空中巴士A 。
接收其餘的波音777後進行了全面的座艙革新，引進平躺式座椅在其新推出的桂冠艙，此外豪華經濟艙也升級成菁英艙[10]。 2000年進行長途機隊的第一次更新，引進4架波音 ER飛機，並保留8架飛機的訂單，同時，長榮航空向波音公司訂購3架波音 LR飛機。 2000年7月取得「台北－東京」航線許可權[7]並於同年9月開航。 [8]2001年1月，長榮航空訂購了其首架空中巴士飛機A 。 2005年10月，長榮航空與日本公司Sanrio合作，推出Hello Kitty彩繪機[40]，使用A 客機（編號B-16303），機身塗上Hello Kitty的圖案。 一年後，推出第二架（編號B-16309），除了機身的圖案外，機艙內也採用Hello Kitty的圖案[41][42]。
長榮航空logo: 機場貴賓室
由於波音787客機使用電子式舷窗，只要控制其中一個窗戶的按鈕，就能同時讓座位旁的兩個窗戶，有由淺至深5個階段的遮陽效果。 在視聽設備上亦全面升級，配置18吋高解像度觸控式螢幕，搭配防噪音耳機；加大的桌面方便旅客用餐或工作，另考量商務人士需求，採用複合式電源插座，適用不同類型的電源插頭，並使用USB插座充電或讀取隨身電子裝備之Media Player、Photo Viewer及PDF Reader，讓舒適的休憩環境可以兼顧工作需求，輕易轉換成臨時辦公室。 2018年10月2日，長榮航空首架租賃波音787-9「夢幻客機」，國籍編號B-17881，在位於美國南卡羅來納州查爾斯頓的波音工廠舉行交機典禮，長榮為凸顯國籍航空首次採用787機型，接受波音提供特殊外觀塗裝設計建議，在四架787-9機身上以放大的787字體，標示出787機型，在白色的機身上，以長榮集團綠、橘企業色彩帶的飛揚線條，呈現787夢幻客機的速度感[45]。 大多數長榮航空航班起點在主要樞紐機場台灣桃園國際機場，飛行業務位於第二航廈，與中國國際航空、聯合航空、韓亞航空、全日空、新加坡航空、土耳其航空、紐西蘭航空、加拿大航空以及等星空聯盟成員共用第二航廈（泰國國際航空目前仍使用第一航廈）。 在視聽設備上亦全面升級，配置18吋高解析度觸控式螢幕，搭配防噪音耳機；加大的桌面方便旅客用餐或工作，另考量商務人士需求，採用複合式電源插座，適用不同類型的電源插頭，並使用USB插座充電或讀取隨身電子裝備之Media Player、Photo Viewer及PDF Reader，讓舒適的休憩環境可以兼顧工作需求，輕易轉換成臨時辦公室。 「商務艙」（Business 長榮航空logo2023 Class）配備於空中巴士A321客機，座位配置單排2-2的組合，前後椅間距達45英吋，寬度達21英吋，配備10.6英吋個人觸控螢幕，並搭配Panasonic eFX影視隨選系統(AVOD)。
